契約者と利用者が異なる場合でも利用できますか？

はい、ご利用いただけます。

ただし、アカウントの共有はできませんので、契約者と利用者の両方が管理画面にアクセスする必要がある場合、どちらかを招待ユーザーとして管理画面へのアクセスを許可するようにしてください。

原則的には契約者がオーナーになりますので、それ以外の方はサイト管理者以下の権限になります。
また、オーナー権限は渡すことが可能ですので、制作時にはオーナーとなり運用が始まったらオーナー権限を渡して自分はサイト管理者になる、といった運用も可能です。