MovableType.net ではテーマを適用すると、それに関連するカスタムフィールドも作成されます。

仕様として別のテーマを再適用した場合に、古いテーマで利用していたカスタムフィールドが残るため（必要なフィールドを削除しないように初期化せずに残しています）不要なフィールドが表示された状態になります。

カスタムフィールドを整理する方法としては、テーマを再適用する前にカスタムフィールド一覧から不要なカスタムフィールドを削除しておく、再適用した後であれば以下の各マニュアルの設定されているカスタムフィールドに記載されているフィールドだけを残して不要なフィールドは削除する、ということになります。

• テーマ「Modern Corporate」の特長と使い方
• テーマ「Lekumo Media」の特長と使い方
• テーマ「Simple Corporate」の特長と使い方
• テーマ「Lekumo Two」の特長と使い方
• テーマ「Lekumo One」の特長と使い方
• テーマ「Owned Media」の特長と使い方
• テーマ「EC Blog」の特長と使い方
• テーマ「EC Brand」の特長と使い方
• テーマ「Landing Page」の特長と使い方
• テーマ「Character」の特長と使い方
• テーマ「Stylish Corporate」の特長と使い方
• テーマ「Public Organization」の特長と使い方
• テーマ「General Blog」の特長と使い方
• テーマ「One Page」の特長と使い方
• テーマ「General Corporate」の特長と使い方
• テーマ「Shop」の特長と使い方
• テーマ「Material Blog」の特長と使い方
• テーマ「Simple Product」の特長と使い方
• テーマ「Gallery Black」の特長と使い方
• テーマ「Rimo」の特長と使い方
• テーマ「MEDIA」の特長と使い方
• テーマ「Rainier」の特長と使い方
• テーマ「Block Layout」の特長と使い方

サイト制作の初期段階ではこういったケースもあると思いますので、ぜひ上記対応をしていただければと思います。